唯野高校水泳部員で、生徒会長でもあった田中（瑛太）は、合格確実といわれていた東大医学部の受験に失敗し、後期募集でかろうじて同じ東大の農学部に滑り込んだ。そのことをアメリカに留学中の交際相手・響子（香椎由宇）に告げることが出来ず、医者である父親からもプレッシャーをかけられていた田中は、何としてでも医学部への転部を果たそうと猛勉強に励んでいた。が、連日の猛勉強がたたって、試験の朝、うっかり寝過ごしてしまった田中は、不覚にも肝心の一般教養を1教科落としてしまう。田中が農学部の教授（中山克己）に泣きつくと、教授は南の島の地図を手渡し、ある交換条件を口にした。それは、夏休みの間、教授の友人が住んでいる冨那島で畜産実習をしろ、というものだった。
冨那島への出発前日、田中は、一時帰国した響子（香椎由宇）と偶然再会する。が、いきなり響子に、「私たち自然消滅しちゃったけど、これからもいいお友達でいましょうね」などと言われてしまい、すっかり落ち込んでしまう。そんな最悪な気分のまま、嫌々島に向かった田中は、連絡船の中で、今日子（小西真奈美）という女性と出会った。彼女は、田中が世話になる上原家の長女で、2カ月ほど前まで東京で看護師をしていた女性だった。今日子は、島で軽食喫茶を営むハル婆（渡辺美佐子）の薬を本島の病院まで取りに行った帰りだった。その薬を誤って海に落としてしまった田中は、海に飛び込んで薬袋を拾おうとして溺れかける。そんな彼を助けたのが、今日子の弟・賢作（小出恵介）と、その仲間の悟（平岡祐太）、俊一郎（柄本佑）という3人の高校生だった。
島に着いた夜、田中は、村長（久保晶）主催の歓迎会に招待される。そこには、賢作たち3人や、彼らのクラスメートでハル婆の孫でもある玲奈（酒井彩名）、賢作の父・耕作（益岡徹）、村議会議長をしている悟の父・大悟（松重豊）、漁師をしている俊一郎の父・俊道（宇梶剛士）らも顔をそろえた。その席で、過疎化が進む島の将来のことで言い争いを始めてしまう俊道と大悟。村長は、そんな2人を制して、島の観光を盛り上げるために夏祭りを復活させる、と言い出す。そのメインイベントとして村長が提案したのは、たまたまテレビに映っていた男子シンクロだった。賢作たちは、村長から、島の観光大使に任命され、強制的にシンクロのメンバーにされてしまうが…。