東京の名門進学校・青葉高校に通っていた高校3年生の水嶋泳吉（市原隼人）は、父・泳太郎（矢島健一）の生まれ故郷にある高校・姫乃高校に転校する。姫乃高校は、3年前に男子学生を受け入れることになった元女子高。生徒数も圧倒的に女子が多く、いまも男子運動部が無いような学校だった。
男子運動部を作りたいと強く願う3年生・山本洋介（中尾明慶）は、転校生の泳吉が青葉高校で水泳部に所属していたことを知り、水泳部を設立しようと決意する。そのアイデアに乗り気を見せたのは、この春から代用教員として同校に赴任した早乙女（金子貴俊）だ。早乙女は、シンクロ公演で全国的に有名な唯野高校の水泳部員だった。しかし、姫乃高校のプールは、共学への移行の際、風紀上の問題から閉鎖され、物置と化していた。英語教師の大原夏子（山口紗弥加）や、古文教師の越野晴香（井上和香）も、男子水泳部の創設には反対だった。
そんな中、駅前で姫乃高校3年生の矢沢栞（石原さとみ）に出会い、彼女の後を追って学校にやってくる泳吉。その途中、用水路に落ちてしまった泳吉は泥だらけだった。
そんな泳吉の姿を見た3年生・川崎仙一（斉藤慶太）は、泳吉がケンカで他校の不良たちをやっつけたと勘違いし、大騒ぎ。そのウワサはあっという間に校内に広がっていた。
泳吉は、栞や洋介、仙一と同じ3年3組に入った。早速泳吉に接近し、水泳部の件を切り出す洋介。すると泳吉は、やや動揺したような表情を見せ、「いいよ、俺は…」と断る。
泳吉が、これから生活することになる祖父・亀吉（今福將雄）の家に向かうと、そこには何故か栞の姿があった。実は、姫乃駅で働く栞の父・明（小日向文世）と泳太郎が親友同士ということもあって、明とその妻・薫（森下愛子）、そして栞の3人は、亀吉の家の母屋を借りて住んでいたのだ。亀吉は離れに住み、矢沢一家に食事や身の回りの世話をしてもらっているのだという。栞は、クラスメートになった泳吉との同居に反発するが…。